Nature des protéines.

1) Les acides aminés, unités de constitution.

Il existe 20 acides aminés différents composant l'alphabet du langage protéique. Ces molécules simples ou peptides possèdent (comme leur nom l'indique !), une fonction acide COOH et une fonction amine NH2. Ce qui différencie les 20 acides aminés est le radical R. Au plus simple c'est un hydrogène H dans la glycine.

Ce radical peut être un groupement SH,


cystéine

ou un noyau benzénique (phénylalanine).


phénylalanine

2) La séquence, structure primaire de la protéine.

La séquence est le nombre et l'ordre dans lequel les acides aminés (aa) sont polymérisés. La liaison s'établit entre la fonction acide d'un acide aminé et la fonction amine du suivant. C'est la liaison peptidique.

3) La configuration spatiale, la structure tertiaire.

La séquence primaire va déterminer différents types de liaisons entre certains des acides aminés de la chaîne polypeptidique, par exemple des ponts disulfures entre acides aminés soufrés. Ainsi, la chaîne polypeptidique se reploie et adopte sa forme dans l'espace.

De cette configuration spatiale ou structure tertiaire dépend la fonctionnalité de la protéine.


Configuration spatiale adoptée par la séquence des 146 aa de la globine β

Configuration spatiale de l'hémoglobine (2 globines α et 2 β)
Des images 3D de différentes molécules à voir ici ! L'affichage peut prendre du temps !
(la visualisation nécessite l'applet JAVA J2SE à télécharger ici.
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